De straten van St. Mystere, een vreemd dorp met nog vreemdere inwoners, zijn gehuld in geheimen. Wanneer een rijke baron komt te overlijden, onthult zijn testament de details van een waardevolle verborgen schat. Met jouw slimheid kun je Professor Layton helpen om de vele puzzels in St. Mystere te ontrafelen en de geheimen die achter elke deur verborgen zijn bloot te leggen.